Датой получения дохода для среднего заработка за время командировки является последний день месяца, за который его начислили. Так решили чиновники (письма Минфина от 09.04.2018 № 03-04-07/23964, ФНС от 17.04.2018 № БС-4-11/7320)
Например, работник был в командировке с 14 по 18 мая. Значит, в последний день мая ему нужно начислить оплату за время, которое сотрудник провел в командировке, и рассчитать НДФЛ