Можно не беспокоиться о вычетах по НДС, если поступит счет-фактура с дополнительной информацией. В данном случае это может быть номер договора, приложения или реквизиты первичного документа. Компания и ИП может указывать в счете-фактуре дополнительную информацию.
Это возможно при условии, что сохранится форма счета-фактуры. В данном случае вычеты вы не потеряете.
Минфин также рассказал, в каких местах в счете-фактуре допустимо указывать дополнительную информацию (письмо от 28.07.2021 № 03-07-09/60435).
Можно, например, прописать дополнительную информацию между шапкой и табличной частью, или же в табличной части счета-фактуры при условии, что последовательность предусмотренных формой граф сохранится.
Министерство также разъяснило, как оформить авансовые счета-фактуры в неясных ситуациях (письмо от 09.09.2021 № 03-07-09/73118).