В случае получения подрядчиком от заказчика компенсации командировочных расходов, подрядчик должен рассчитать и уплатить с нее НДС. Такой вывод содержится в письме Минфина РФ №03-07-11/22989 от 22.04.2015 г. Согласно мнению чиновников подрядчик должен рассчитать с компенсации НДС по ставке 18/118, составить счет-фактуру в одном экземпляре и зарегистрировать его в книге продаж, где в графе 2 указать код 09. При этом заказчик не вправе заявлять вычет, так как подрядчик не передает ему этот счет-фактуру. Но сам подрядчик может принять к вычету налог на командировочным расходам.
