Если компания не удержала НДФЛ и этот факт обнаружили инспекторы при проверке, то с доначисленного НДФЛ пени начислять не положено. Это подтвердили в письме № ЕД-4-2/13600 от 04.08.2015 чиновники из ФНС. Пени положены если налоговый агент удержал налог, но не перечислил его в бюджет.